Bonjour !
Le site de la Deutsche Bahn propose de bon résultats pour ce genre de trajets et offre la possibilité de spécifier que l’on veut emporter un vélo.
Pour l’aller https://www.bahn.de/buchung/start?vbid=db2c0840-6e42-4e28-b208-762c69c842df par exemple.
Pour le retour j’ai trouvé avec le train de nuit Amsterdam> Basel>Mulhouse>Lyon (https://www.bahn.de/buchung/start?vbid=e5cf8cdf-2e07-474e-a153-1349162ef9e1)